RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472161.1

RPS3AP49-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 49, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP49, Length 790 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP49-201ENST00000472161 GLRA2P23416 452 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TMOD1P28289 359 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ARL2P36404 184 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PHKA2P46019 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ERVFC1P60507 584 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 USP4Q13107 963 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 KCNC3Q14003 757 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TRIM29Q14134 588 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF174Q15697 407 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 XKR9Q5GH70 373 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TTC38Q5R3I4 469 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TPH2Q8IWU9 490 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 HELQQ8TDG4 1101 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRC15Q8TF66 581 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PPME1Q9Y570 386 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 MYH11P35749 1972 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TRIP11Q15643 1979 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 FGF18O76093 207 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TECP42680 631 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PTPROQ16827 1216 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LONRF3Q496Y0 759 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 KCNK18Q7Z418 384 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRC43Q8N309 656 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SVOPQ8N4V2 548 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 RNF149Q8NC42 400 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 POF1BQ8WVV4 589 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 SCLT1Q96NL6 688 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CLEC1BQ9P126 229 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TSC2P49815 1807 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 HIDE1A8MVS5 230 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 F8W810 466 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF623O75123 536 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 OFD1O75665 1012 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 EFEMP2O95967 443 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 RPA1P27694 616 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 GJB2P29033 226 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 TRAPPC10P48553 1259 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 DNM2P50570 870 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PTENP60484 403 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 MAPK7Q13164 816 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 NCOA4Q13772 614 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ODR4Q5SWX8 454 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 DAW1Q8N136 415 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 RNF169Q8NCN4 708 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CPB2Q96IY4 423 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS3AP49-201ENST00000472161 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms