RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 GZMAP12544 262 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 PDE6CP51160 858 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GPC5P78333 572 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GCNT1Q02742 428 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 TCEAL1Q15170 157 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 Q3C1V9 767 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 IFT20Q8IY31 132 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 PCDHB18PQ96TA0 734 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ARIH2O95376 493 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 LDHAP00338 332 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CYP11B1P15538 503 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 TNNI1P19237 187 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ACOT2P49753 483 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CAPSQ13938 189 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 SCFD2Q8WU76 684 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF516Q92618 1163 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GLG1Q92896 1179 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 TATDN2Q93075 761 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC102AQ96A19 550 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 MROH8Q9H579 483 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 COG5Q9UP83 839 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ADCY3O60266 1144 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 EPHB4P54760 987 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 FMO1Q01740 532 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CDR2Q01850 454 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GPR20Q99678 358 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ACP6Q9NPH0 428 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 MED4Q9NPJ6 270 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.48■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GLI1P08151 1106 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 MMEP08473 750 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ZACNQ401N2 412 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 WDR78Q5VTH9 848 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 EMBQ6PCB8 327 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 HAPLN2Q9GZV7 340 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GDF3Q9NR23 364 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 A0A0B4J269 797 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 WDR44Q5JSH3 913 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 C11orf63Q6NUN7 778 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 KLHL7Q8IXQ5 586 aa18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 LGR5O75473 907 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 KRT5P13647 590 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 MARK3P27448 753 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 PIK3CAP42336 1068 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 GUCY2DQ02846 1103 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 HSDL1Q3SXM5 330 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 IER5Q5VY09 327 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 FAM71BQ8TC56 605 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.46■□□□□ 0.55
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC188H7C350 402 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 HLA-DRAP01903 254 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 EFNA5P52803 228 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 WNT7BP56706 349 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 DRP2Q13474 957 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 SNAPC2Q13487 334 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 BIRC3Q13489 604 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 TCP11Q8WWU5 503 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 FAM84AQ96KN4 292 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 KRIT1O00522 736 aa18.45■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 RAD51CO43502 376 aa18.45■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 EDN1P05305 212 aa18.45■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 ERVK-9P63128 1117 aa18.45■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 PAK2Q13177 524 aa18.45■□□□□ 0.54
FAAP20-211ENST00000469733 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms