RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465393.1

TNIK-208, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-208ENST00000465393 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 CDT1Q9H211 546 aa22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PARVGQ9HBI0 331 aa22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 MARCH5Q9NX47 278 aa22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 GDAQ9Y2T3 454 aa22.05■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PTGESO14684 152 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 MBTPS2O43462 519 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 F13A1P00488 732 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 SCP2P22307 547 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 ZNF131P52739 623 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 COASYQ13057 564 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TUSC3Q13454 348 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 KCNC3Q14003 757 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TCHPQ9BT92 498 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 SPTLC2O15270 562 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 YEATS4O95619 227 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 THP07101 528 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 MCF2P10911 925 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PROZP22891 400 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 GRM5P41594 1212 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 ZPBP2Q6X784 338 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 MYCT1Q8N699 235 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 KCNN1Q92952 543 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 MUC3AQ02505 3323 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PPP6R2O75170 966 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TOM1L1O75674 476 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 BRD1O95696 1058 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 SOD2P04179 222 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PTPN14Q15678 1187 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 CASP10Q92851 521 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.02■■□□□ 1.12
TNIK-208ENST00000465393 K7ENM7 598 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ABLIM1O14639 778 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 EFEMP2O95967 443 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 URODP06132 367 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 SV2BQ7L1I2 683 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ZBTB33Q86T24 672 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 CEP120Q8N960 986 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.01■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 F8W810 466 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 TRAK2O60296 914 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ABCD1P33897 745 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 STAT6P42226 847 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 PKP1Q13835 747 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 NAB2Q15742 525 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ATL3Q6DD88 541 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 FUT10Q6P4F1 479 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 BICD1Q96G01 975 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 CXCL16Q9H2A7 254 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 C5orf42Q9H799 3197 aa22■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 GLUD2P49448 558 aa21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 OSTNP61366 133 aa21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 ACAP3Q96P50 834 aa21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 CLDN3O15551 220 aa21.98■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 CUTAO60888 179 aa21.98■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 LILRB3O75022 631 aa21.98■■□□□ 1.11
TNIK-208ENST00000465393 TADA2AO75478 443 aa21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms