RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 PFKFB1P16118 471 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 PROZP22891 400 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 OR1G1P47890 313 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SCNN1GP51170 649 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 MCL1Q07820 350 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TMC7Q7Z402 723 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 CDT1Q9H211 546 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 KLK14Q9P0G3 267 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 USP20Q9Y2K6 914 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 FSIP1Q8NA03 581 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 IGSF21Q96ID5 467 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 ZFP42Q96MM3 310 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 CLTAP09496 248 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TUSC3Q13454 348 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 UNC13DQ70J99 1090 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 STAMQ92783 540 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 HLA-CQ95604 372 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 UROC1Q96N76 676 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 NRP1O14786 923 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 DDHD2O94830 711 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 AFMP43652 599 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 OSTNP61366 133 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 CD302Q8IX05 232 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TCF25Q9BQ70 676 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 HPSEQ9Y251 543 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 OGTO15294 1046 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TADA2AO75478 443 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 EDN1P05305 212 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SLC11A1P49279 550 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 DSC1Q08554 894 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 COASYQ13057 564 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 PSMD2Q13200 908 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 FIZ1Q96SL8 496 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TLE6Q9H808 572 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 THEGQ9P2T0 379 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 HCSTQ9UBK5 93 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 KIF20AO95235 890 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 CA8P35219 290 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 PBX3P40426 434 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 NDUFA8P51970 172 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 VPS52Q8N1B4 723 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 PAGE5Q96GU1 130 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 A0A0B4J269 797 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 TRAPPC3O43617 180 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 EXOC1Q9NV70 894 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 MIOSQ9NXC5 875 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.44■■□□□ 1.18
IMP4-209ENST00000462357 CDH23Q9H251 3354 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms