RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 H0YCG3 227 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 MAPTP10636 758 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 GIT2Q14161 759 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB33Q86T24 672 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 MYCT1Q8N699 235 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 VN1R2Q8NFZ6 395 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 CDT1Q9H211 546 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 STK17AQ9UEE5 414 aa26.31■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 SPTLC2O15270 562 aa26.3■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 PARVGQ9HBI0 331 aa26.3■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 MBTPS2O43462 519 aa26.29■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 THP07101 528 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF131P52739 623 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 NCKAP1LP55160 1127 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 COASYQ13057 564 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 HAUS6Q7Z4H7 955 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 PANK2Q9BZ23 570 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.29■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 F8W810 466 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 MCF2P10911 925 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 PROZP22891 400 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 GRM5P41594 1212 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 OSTNP61366 133 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 TUSC3Q13454 348 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 PKP1Q13835 747 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 KCNC3Q14003 757 aa26.28■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN14Q15678 1187 aa26.28■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 CEP120Q8N960 986 aa26.28■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 K7ENM7 598 aa26.27■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 TOM1L1O75674 476 aa26.27■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 YEATS4O95619 227 aa26.27■■□□□ 1.8
SMKR1-201ENST00000462322 SOD2P04179 222 aa26.27■■□□□ 1.8
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SMKR1-201ENST00000462322 URODP06132 367 aa26.26■■□□□ 1.79
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SMKR1-201ENST00000462322 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 ZPBP2Q6X784 338 aa26.26■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 DYMQ7RTS9 669 aa26.26■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 TAS1R1Q7RTX1 841 aa26.26■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 CASP10Q92851 521 aa26.26■■□□□ 1.79
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SMKR1-201ENST00000462322 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.26■■□□□ 1.79
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SMKR1-201ENST00000462322 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
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SMKR1-201ENST00000462322 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.25■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.25■■□□□ 1.79
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SMKR1-201ENST00000462322 TBX20Q9UMR3 447 aa26.25■■□□□ 1.79
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SMKR1-201ENST00000462322 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 GLUD2P49448 558 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 NAB2Q15742 525 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 FUT10Q6P4F1 479 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 DDX12PQ92771 950 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 KCNN1Q92952 543 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 ACAP3Q96P50 834 aa26.24■■□□□ 1.79
SMKR1-201ENST00000462322 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.24■■□□□ 1.79
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