RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-230	ENST00000462130	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	KCNK12	Q9HB15	430 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ARL5C	A6NH57	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	STK25	O00506	426 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	INPPL1	O15357	1258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TEX28	O15482	410 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TSPAN1	O60635	241 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	DGAT1	O75907	488 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SLITRK3	O94933	977 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	MYB	P10242	640 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TXK	P42681	527 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	GLUD2	P49448	558 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SCNN1G	P51170	649 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PIDD1	Q9HB75	910 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	HES2	Q9Y543	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	DMD	P11532	3685 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	STX6	O43752	255 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	RFX1	P22670	979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	BECN1	Q14457	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CALCRL	Q16602	461 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ZFP42	Q96MM3	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CLUH	O75153	1309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CFAP54	Q96N23	3096 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	RFPL2	O75678	378 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	NPTXR	O95502	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	AOC1	P19801	751 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	AKAP5	P24588	427 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	NBL1	P41271	181 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	DSG1	Q02413	1049 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	DSC1	Q08554	894 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CAPS	Q13938	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	FUT10	Q6P4F1	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SIX5	Q8N196	739 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PARP2	Q9UGN5	583 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130		F8W810	466 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	PI15	O43692	258 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	NEMF	O60524	1076 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TADA2A	O75478	443 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	LYPLA2	O95372	231 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	CFH	P08603	1231 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	GLRA2	P23416	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	ARL2	P36404	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-230	ENST00000462130	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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