RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 USP25Q9UHP3 1055 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 LZTS1Q9Y250 596 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PQ27 194 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PQ64 194 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PQD8 194 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 GCNT3O95395 438 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 SLFN14P0C7P3 912 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJB1P25685 340 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 SYKP43405 635 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 AFMP43652 599 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 OR1G1P47890 313 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 SLC11A1P49279 550 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 GRIK3Q13003 919 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 FSIP1Q8NA03 581 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 HVCN1Q96D96 273 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ACAP3Q96P50 834 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 THP07101 528 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 CAMK1Q14012 370 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 CEP120Q8N960 986 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 IGSF21Q96ID5 467 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TRANK1O15050 2925 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ABLIM1O14639 778 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 NRP1O14786 923 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PIGRP01833 764 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 MCL1Q07820 350 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 COASYQ13057 564 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ALCAMQ13740 583 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TMC7Q7Z402 723 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ACCSQ96QU6 501 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 HPSEQ9Y251 543 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 B4GALT3O60512 393 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 NDUFA8P51970 172 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ERVFC1P60507 584 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 DSC1Q08554 894 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PAGE5Q96GU1 130 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 IRS1P35568 1242 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TUSC3Q13454 348 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 KYAT1Q16773 422 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 UNC13DQ70J99 1090 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TCF25Q9BQ70 676 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 STK39Q9UEW8 545 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TRIP11Q15643 1979 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 PTGESO14684 152 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 NCK2O43639 380 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R37O75864 691 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 MYBP10242 640 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 CASP1P29466 404 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 CA8P35219 290 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 SEZ6Q53EL9 994 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 VPS52Q8N1B4 723 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 HLA-CQ95604 372 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 STRA6Q9BX79 667 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 IGFLR1Q9H665 355 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 THEGQ9P2T0 379 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 COG5Q9UP83 839 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 COL6A3P12111 3177 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 CITO14578 2027 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 OGTO15294 1046 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 CLTAP09496 248 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 CUL4BQ13620 913 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 POSTNQ15063 836 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-202ENST00000460308 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.38■■□□□ 1.33
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