RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 TMX1Q9H3N1 280 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 SIX2Q9NPC8 291 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIP11Q15643 1979 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A1W2PQY0 241 aa22.7■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 FAM187BQ17R55 369 aa22.7■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.7■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 RRAGAQ7L523 313 aa22.69■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 SV2AQ7L0J3 742 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 MXI1P50539 228 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM14Q14142 442 aa22.67■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 NUP58Q9BVL2 599 aa22.67■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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SH3BP2-204ENST00000452765 SESTD1Q86VW0 696 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 NOD1Q9Y239 953 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 B4GALT4O60513 344 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 EPC2Q52LR7 807 aa22.65■■□□□ 1.22
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