RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 NXPE3Q969Y0 559 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 FZD8Q9H461 694 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 WNT16Q9UBV4 365 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 PARP2Q9UGN5 583 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF292O60281 2723 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 TUSC3Q13454 348 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 POTEGQ6S5H5 508 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
GCSHP5-201ENST00000443090 KRBA1A5PL33 1030 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 FOSBP53539 338 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 RTP2Q5QGT7 225 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 SNX27Q96L92 541 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PTGESO14684 152 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 MED24O75448 989 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 TADA2AO75478 443 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ZMYND10O75800 440 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CFHP08603 1231 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 SRFP11831 508 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ST3GAL1Q11201 340 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM29Q14134 588 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 BSNDQ8WZ55 320 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PIDD1Q9HB75 910 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXW11Q9UKB1 542 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 FRYLO94915 3013 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ANHXE9PGG2 379 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 N4BP3O15049 544 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 KIF4AO95239 1232 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 LAMP2P13473 410 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ATP2B1P20020 1258 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ANGPT1Q15389 498 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 NAB2Q15742 525 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 NACC1Q96RE7 527 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 VWA8A3KMH1 1905 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 MCM7P33993 719 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 HTR4Q13639 388 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 HASPINQ8TF76 798 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 TTPALQ9BTX7 342 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 SNTG2Q9NY99 539 aa21.98■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 RECQL4O94761 1208 aa21.97■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 EDN1P05305 212 aa21.97■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 RPA1P27694 616 aa21.97■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CA14Q9ULX7 337 aa21.97■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ACKR2O00590 384 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PRKCBP05771 671 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 THP07101 528 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CYP11B2P19099 503 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 NAMPTP43490 491 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 NEK4P51957 841 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PSMD5Q16401 504 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 MAPK6Q16659 721 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 PADI6Q6TGC4 694 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 GPR152Q8TDT2 470 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.96■■□□□ 1.11
GCSHP5-201ENST00000443090 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 OR52Z1P0C646 297 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 HOXA9P31269 272 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 USP20Q9Y2K6 914 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.95■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GCSHP5-201ENST00000443090 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms