RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 ANKS1AQ92625 1134 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 USP17L3A6NCW0 530 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 USP17L4A6NCW7 530 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PSMA2P25787 234 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PARP10Q53GL7 1025 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CYP27B1O15528 508 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 HIF1AQ16665 826 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 KLC3Q6P597 504 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 APPL1Q9UKG1 709 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 GGPS1O95749 300 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 DLGAP3O95886 979 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM60Q495X7 471 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.5■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 E7ENQ6 273 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 SERPINB8P50452 374 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 RASGRF1Q13972 1273 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ITGA8P53708 1063 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 GPR141Q7Z602 305 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF786Q8N393 782 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 NMT2O60551 498 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC103Q8IW40 242 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ASAP2O43150 1006 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TNNC2P02585 160 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 FBXO11Q86XK2 927 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 KPNA7A9QM74 516 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 STRNO43815 780 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 KCNJ2P63252 427 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 KCNK16Q96T55 309 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 KLC2Q9H0B6 622 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.49■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 A0A0G2JLW4 131 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 SOX5P35711 763 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PLD3Q8IV08 490 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 MID2Q9UJV3 735 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM16O95361 564 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 P4HA1P13674 534 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 MCAMP43121 646 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 MAP3K7CLP57077 242 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 MAGEB18Q96M61 343 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM49P0CI25 452 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM49CP0CI26 452 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ATL2Q8NHH9 583 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 GIPC2Q8TF65 315 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 STK32AQ8WU08 396 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 CSRNP1Q96S65 589 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 H0Y626 953 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 O00370 1275 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ETS2P15036 469 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ITIH2P19823 946 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 TRAPPC3O43617 180 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 IL10P22301 178 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 STK4Q13043 487 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 STX3Q13277 289 aa15.48■□□□□ 0.07
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF394Q53GI3 561 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms