RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 WWP1Q9H0M0 922 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 GOLGA8RI6L899 631 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 MMP10P09238 476 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PRLRP16471 622 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 TAC1P20366 129 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 KYNUQ16719 465 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 LCA5Q86VQ0 697 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM167AQ96KS9 214 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM120BA0PK00 339 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 H3BQF6 201 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 GSTA4O15217 222 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 RASA1P20936 1047 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 COMTP21964 271 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 GPC3P51654 580 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC29A2Q14542 456 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC26A7Q8TE54 656 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF146Q9NTX7 359 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.85□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A087X0T9 212 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 M0QYV0 167 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC26A4O43511 780 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC4A1P02730 911 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM228BP0C875 321 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 KCNJ1P48048 391 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 P3H1Q32P28 736 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ARL8AQ96BM9 186 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SMARCA1P28370 1054 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CDH6P55285 790 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 TAP1Q03518 808 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ST3GAL1Q11201 340 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FGD4Q96M96 766 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FLT1P17948 1338 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FIGNQ5HY92 759 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ERP27Q96DN0 273 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CREB3O43889 395 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CHEK2O96017 543 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PDHBP11177 359 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CCND1P24385 295 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 PMLP29590 882 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 TYK2P29597 1187 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 KIF19Q2TAC6 998 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 MDM1Q8TC05 714 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 CARD9Q9H257 536 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 NAGPAQ9UK23 515 aa11.84□□□□□ -0.51
SEMA4D-211ENST00000438547 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 Q3C1V9 767 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 TTI2Q6NXR4 508 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 BARGINQ6ZT62 677 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 LDHDQ86WU2 507 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF302Q9NR11 478 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 KRT82Q9NSB4 513 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 BFARQ9NZS9 450 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 ASAP2O43150 1006 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 BAG6P46379 1132 aa11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFAIP2Q03169 654 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms