RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422593.5

NICN1-202, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 3

Gene NICN1, Length 742 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-202ENST00000422593 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.63□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 NEMFO60524 1076 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 C1RP00736 705 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SRFP11831 508 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 LAMP2P13473 410 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ATP2B1P20020 1258 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CREMQ03060 361 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CEP57Q86XR8 500 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 HASPINQ8TF76 798 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 POTEMA6NI47 508 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 WNT7AO00755 349 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ZMYND10O75800 440 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 LIG1P18858 919 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TUSC3Q13454 348 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TRIM29Q14134 588 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ME3Q16798 604 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SPECC1Q5M775 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 GPR65Q8IYL9 337 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 GPR152Q8TDT2 470 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 MTMR9Q96QG7 549 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 DMDP11532 3685 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 FAM186AA6NE01 2351 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 NOTCH4Q99466 2003 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 LARGE1O95461 756 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 THP07101 528 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 FSHRP23945 695 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 RTP2Q5QGT7 225 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 POTEGQ6S5H5 508 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TTPALQ9BTX7 342 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SNTG2Q9NY99 539 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.6□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 N4BP3O15049 544 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PAPLNO95428 1278 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 MCM7P33993 719 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ANAPC15P60006 121 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PSMD5Q16401 504 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 GTF3C6Q969F1 213 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 NACC1Q96RE7 527 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 FZD8Q9H461 694 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 POLIQ9UNA4 740 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 USP20Q9Y2K6 914 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 MYH11P35749 1972 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 CITO14578 2027 aa14.59□□□□□ -0.07
NICN1-202ENST00000422593 ANHXE9PGG2 379 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 PTGESO14684 152 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 JAK2O60674 1132 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 MED24O75448 989 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 KIF4AO95239 1232 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 ID4P47928 161 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 NTHL1P78549 312 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 FOXK2Q01167 660 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 HTR4Q13639 388 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 MAPK6Q16659 721 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 FAM187BQ17R55 369 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 LIN9Q5TKA1 542 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.58□□□□□ -0.08
NICN1-202ENST00000422593 GDAQ9Y2T3 454 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms