RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 KRT17Q04695 432 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 IFT43Q96FT9 208 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 ATG4CQ96DT6 458 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A14Q96JA4 679 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINI1Q99574 410 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 POLLQ9UGP5 575 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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PTPRJ-201ENST00000418331 ITSN1Q15811 1721 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NPEPPSP55786 919 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 COPS2P61201 443 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 APOL1O14791 398 aa22.65■■□□□ 1.22
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