RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 A0A0B4J269 797 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CYP11B1P15538 503 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GRM1Q13255 1194 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PPP2R5EQ16537 467 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 KAT5Q92993 513 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 OPTNQ96CV9 577 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 MMP19Q99542 508 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ST7Q9NRC1 585 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.72■■□□□ 1.07
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SUMO3-204ENST00000411651 SGPL1O95470 568 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 MYBL2P10244 700 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ABCB4P21439 1286 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 AP3M2P53677 418 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GPR20Q99678 358 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PNMA3Q9UL41 463 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SCN4AP35499 1836 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CYP26A1O43174 497 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 BPIFB4P59827 614 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 FMO1Q01740 532 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CAPSQ13938 189 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 H3BQF6 201 aa21.71■■□□□ 1.07
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SUMO3-204ENST00000411651 CEP104O60308 925 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SORBS3O60504 671 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PEX10O60683 326 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SNAPC2Q13487 334 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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SUMO3-204ENST00000411651 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ZMYND10O75800 440 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CYP1A2P05177 515 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PAK2Q13177 524 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 WDR44Q5JSH3 913 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CGRRF1Q99675 332 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.7■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ASB14A6NK59 587 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 USP8P40818 1118 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 DNA2P51530 1060 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF516Q92618 1163 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 KRT12Q99456 494 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 COG5Q9UP83 839 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 ERVK-9P63128 1117 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 LY6KQ17RY6 165 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 ARIH2O95376 493 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 HSPA6P17066 643 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 Q3C1V9 767 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 MREGQ8N565 214 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 TOM1L1O75674 476 aa21.68■■□□□ 1.06
SUMO3-204ENST00000411651 HLA-DRAP01903 254 aa21.68■■□□□ 1.06
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