RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 PALMO75781 387 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SMPD1P17405 629 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 SHC3Q92529 594 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 ZACNQ401N2 412 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.46■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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USP39-202ENST00000409025 ZBTB33Q86T24 672 aa20.45■□□□□ 0.86
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USP39-202ENST00000409025 CAGE1Q8TC20 777 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-202ENST00000409025 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.45■□□□□ 0.86
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USP39-202ENST00000409025 TMOD1P28289 359 aa20.43■□□□□ 0.86
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USP39-202ENST00000409025 AP3M2P53677 418 aa20.43■□□□□ 0.86
USP39-202ENST00000409025 TNFAIP2Q03169 654 aa20.43■□□□□ 0.86
USP39-202ENST00000409025 GRM1Q13255 1194 aa20.43■□□□□ 0.86
USP39-202ENST00000409025 DGKDQ16760 1214 aa20.43■□□□□ 0.86
USP39-202ENST00000409025 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.43■□□□□ 0.86
USP39-202ENST00000409025 SEZ6Q53EL9 994 aa20.43■□□□□ 0.86
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