RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.74□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 KIF4AO95239 1232 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CFHP08603 1231 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ANAPC15P60006 121 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 NTHL1P78549 312 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GRIK3Q13003 919 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ECM1Q16610 540 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 POTEHQ6S545 545 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 FNIP2Q9P278 1114 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CACNA1AO00555 2505 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ANHXE9PGG2 379 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 SEC24BO95487 1268 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GUCY1B3Q02153 619 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 HTR4Q13639 388 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 FAM187BQ17R55 369 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 USP41Q3LFD5 358 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 WASF1Q92558 559 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 SNTG2Q9NY99 539 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 PARP2Q9UGN5 583 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 CA14Q9ULX7 337 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 VWA8A3KMH1 1905 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.72□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ZMYND10O75800 440 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 RECQL4O94761 1208 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 LAMP2P13473 410 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ATP2B1P20020 1258 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 MCM7P33993 719 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 ANGPT1Q15389 498 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GPR65Q8IYL9 337 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 GPR152Q8TDT2 470 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-202ENST00000393503 NOTCH4Q99466 2003 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GLULP15104 373 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TUSC3Q13454 348 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FGF14Q92915 247 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 WNT16Q9UBV4 365 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LRRN2O75325 713 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 C1RP00736 705 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SRFP11831 508 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NEK4P51957 841 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NBR1Q14596 966 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD1Q15327 319 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF174Q15697 407 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PADI6Q6TGC4 694 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PARM1Q6UWI2 310 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TTPALQ9BTX7 342 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TADA2AO75478 443 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PRKCBP05771 671 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CYP11B2P19099 503 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms