RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 PTPN21Q16825 1174 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 HASPINQ8TF76 798 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 MFSD14AQ96MC6 490 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 RUSC1Q9BVN2 902 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.083e-6■■■■■ 109.1
FAAP20-202ENST00000378546 C2CD4DB7Z1M9 353 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 LILRB3O75022 631 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 THP07101 528 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 DSG1Q02413 1049 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 USP41Q3LFD5 358 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 PLIN2Q99541 437 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 KMT5AQ9NQR1 393 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 DPP7Q9UHL4 492 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 PLXNA3P51805 1871 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 NPTX2P47972 431 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 GLYCTKQ8IVS8 523 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 NT5C3AQ9H0P0 336 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 MYBP10242 640 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 NT5DC1Q5TFE4 455 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC149Q6ZUS6 474 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 KCNK18Q7Z418 384 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PBXIP1Q96AQ6 731 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.071e-7■□□□□ 9
FAAP20-202ENST00000378546 TECTAO75443 2155 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PTGESO14684 152 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CREMQ03060 361 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 GPR149Q86SP6 731 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TIPINQ9BVW5 301 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 DENND4AQ7Z401 1863 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 KIF4AO95239 1232 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 EFEMP2O95967 443 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 YARSP54577 528 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 GLRA4Q5JXX5 417 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CEP57Q86XR8 500 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PALB2Q86YC2 1186 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 DAW1Q8N136 415 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 KREMEN2Q8NCW0 462 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 RXFP1Q9HBX9 757 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CHST7Q9NS84 486 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 MYH11P35749 1972 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 C2orf16Q68DN1 1984 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 MTMR3Q13615 1198 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PNMA5Q96PV4 448 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TCHPQ9BT92 498 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CXCL16Q9H2A7 254 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 C17orf75Q9HAS0 396 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SFI1A8K8P3 1242 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SLC16A4O15374 487 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SPATA31D3P0C874 917 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 HARSP12081 509 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 GUCY2CP25092 1073 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 OSTNP61366 133 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 STRN3Q13033 797 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PLCD3Q8N3E9 789 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 SORCS3Q9UPU3 1222 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 MAPK7Q13164 816 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 HYIQ5T013 277 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 OTOP3Q7RTS5 596 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 BRAPQ7Z569 592 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CALML4Q96GE6 196 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TTPALQ9BTX7 342 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-202ENST00000378546 CDT1Q9H211 546 aa27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms