RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 HTR4Q13639 388 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CALCRLQ16602 461 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 RABGGTAQ92696 567 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 MTMR9Q96QG7 549 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FZD8Q9H461 694 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 KLK14Q9P0G3 267 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.096e-6■■■■■ 103.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DTNBO60941 627 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 TXKP42681 527 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM187BQ17R55 369 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 RTP2Q5QGT7 225 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTPALQ9BTX7 342 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDH7Q9ULB5 785 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A087WWV3 80 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FSHRP23945 695 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 STARD6P59095 220 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD1Q15327 319 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SHDQ96IW2 340 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CEP250Q9BV73 2442 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 BTBD18B2RXH4 712 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTGESO14684 152 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 NEMFO60524 1076 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 THP07101 528 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXA9P31269 272 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPC5P78333 572 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PDXDC1Q6P996 788 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 R4GN57 208 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 N4BP3O15049 544 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIF4AO95239 1232 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 POU2F2P09086 479 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SP9P0CG40 484 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP2B1P20020 1258 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANAPC15P60006 121 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 NAB2Q15742 525 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PSMD5Q16401 504 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 UVSSAQ2YD98 709 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPECC1Q5M775 1068 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 LIN9Q5TKA1 542 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PARM1Q6UWI2 310 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 CEP57Q86XR8 500 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FGF13Q92913 245 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 FGF14Q92915 247 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 NACC1Q96RE7 527 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNTG2Q9NY99 539 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-201ENST00000373159 ACKR2O00590 384 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms