RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SCGB1D2O95969 90 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2C19P33261 490 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 USP45Q70EL2 814 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CHPFQ8IZ52 775 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CHST13Q8NET6 341 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH6Q9H252 994 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 DEF6Q9H4E7 631 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPAN6O43657 245 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MFAP3LO75121 409 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 IL2RBP14784 551 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 GNAT2P19087 354 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FPR1P21462 350 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FLT3LGP49771 235 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 DSC2Q02487 901 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 HHEXQ03014 270 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SP140Q13342 867 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 HS1BP3Q53T59 392 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKS6Q68DC2 871 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 DOK3Q7L591 496 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM83AQ86UY5 434 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 XYLT1Q86Y38 959 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ST8SIA2Q92186 375 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 EDAQ92838 391 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT5Q92993 513 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB24Q969Q5 203 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MIEF2Q96C03 454 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM89AQ96GI7 184 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf49Q96NF6 230 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TDP1Q9NUW8 608 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM140Q9NV12 185 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPN14A8MX76 684 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SGTAO43765 313 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 DDCP20711 480 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PCSK1P29120 753 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP8B2P98198 1209 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC42EP1Q00587 391 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 EFEMP1Q12805 493 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MTM1Q13496 603 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 CSRP2Q16527 193 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 AFMIDQ63HM1 303 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC7BQ86TV6 843 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 HPS3Q969F9 1004 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 AIFM3Q96NN9 605 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ADOQ96SZ5 270 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 KLC2Q9H0B6 622 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 B5MCH6 92 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PJA2O43164 708 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR32O75388 356 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 OFD1O75665 1012 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDH1A3P47895 512 aa5.04□□□□□ -1.6
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