RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TADA2AO75478 443 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CETPP11597 493 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 LIFRP42702 1097 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CACNB3P54284 484 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 MICALL2Q8IY33 904 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SLC35F6Q8N357 371 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF446Q9NWS9 450 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 MAPK13O15264 365 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 MAN1A2O60476 641 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 GNA15P30679 374 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 QARSP47897 775 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SKOR1P84550 965 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 GRM4Q14833 912 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PASD1Q8IV76 773 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 LXNQ9BS40 222 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PFDN1O60925 122 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ACSL3O95573 720 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 GH1P01241 217 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 KRT4P19013 534 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 FCGRTP55899 365 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 HDAC4P56524 1084 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SPARCL1Q14515 664 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SLC9A5Q14940 896 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PROSER3Q2NL68 480 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PIGBQ92521 554 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CCDC78A2IDD5 438 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 LRRC53A6NM62 1247 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 RCAN1P53805 252 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 POU5F1BQ06416 359 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 WDR93Q6P2C0 686 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SNX31Q8N9S9 440 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PFASO15067 1338 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 USP27XA6NNY8 438 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PSMD3O43242 534 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PRKCBP05771 671 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 LCP1P13796 627 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 MTMR2Q13614 643 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ANKS6Q68DC2 871 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TIPINQ9BVW5 301 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 A0A0G2JND7 137 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SRGAP2O75044 1071 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 LRG1P02750 347 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CHRNA3P32297 505 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 BCAR1P56945 870 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 NNTQ13423 1086 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ARHGAP18Q8N392 663 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CRB1P82279 1406 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CCDC188H7C350 402 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 GSNP06396 782 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CPT1AP50416 773 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TRADDQ15628 312 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 LINC00301Q8NCQ3 95 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 DYDC2Q96IM9 177 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 PTPRMP28827 1452 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 WDR91A4D1P6 747 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ZW10O43264 779 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 ARHGEF9O43307 516 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-202ENST00000356435 HMGCS2P54868 508 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms