RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 GGA3Q9NZ52 723 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 NFS1Q9Y697 457 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 COMTP21964 271 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 XKR3Q5GH77 459 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM84AQ96KN4 292 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 GRIN3BO60391 1043 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 COPB2P35606 906 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PEX5P50542 639 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PDE6CP51160 858 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 IRAK1P51617 712 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 EMC2Q15006 297 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 MTERF2Q49AM1 385 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 USP37Q86T82 979 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC45Q96CN5 670 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPC6Q9Y210 931 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 OTOFQ9HC10 1997 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ATG7O95352 703 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ICAM3P32942 547 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CLDN10P78369 228 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 GCNT1Q02742 428 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 FSTL1Q12841 308 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP2R5EQ16537 467 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF516Q92618 1163 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 IFT74Q96LB3 600 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PPFIA4O75335 1185 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 WNT7BP56706 349 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 MESDQ14696 234 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CLUL1Q15846 466 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 EMC10Q5UCC4 262 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 KCTD16Q68DU8 428 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 MORC4Q8TE76 937 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP85Q9BW27 656 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 H0YCG3 227 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF653Q96CK0 615 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 BICD1Q96G01 975 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP89Q96ST8 783 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 EXTL3O43909 919 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DR1Q01658 176 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DUPD1Q68J44 220 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DPH5Q9H2P9 285 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMD6Q15008 389 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PRELID2Q8N945 189 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DNERQ8NFT8 737 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 BTBD6Q96KE9 485 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB17Q9H0T7 212 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM187AA6NFU0 413 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 TULP2O00295 520 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF2O75151 1096 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGRP01833 764 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 OATP04181 439 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA6P17066 643 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CTNNA2P26232 953 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCD1P33897 745 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-202ENST00000335475 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms