RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.33■■□□□ 1.33
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SOCS1-201ENST00000332029 NPR3P17342 541 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 AOC1P19801 751 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 NBL1P41271 181 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 USP41Q3LFD5 358 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 PALB2Q86YC2 1186 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 SIX5Q8N196 739 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.33■■□□□ 1.33
SOCS1-201ENST00000332029 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.33■■□□□ 1.33
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SOCS1-201ENST00000332029 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 NBR1Q14596 966 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RABEP1Q15276 862 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PADI6Q6TGC4 694 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 GPR65Q8IYL9 337 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RABGGTAQ92696 567 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 FNIP2Q9P278 1114 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.32■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PLXNA3P51805 1871 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PI15O43692 258 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PAPLNO95428 1278 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 MUTP22033 750 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CREMQ03060 361 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 ASCL5Q7RTU5 278 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 MYADMQ96S97 322 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PIDD1Q9HB75 910 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.31■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 DMDP11532 3685 aa23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 TADA2AO75478 443 aa23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CYP11B2P19099 503 aa23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PRR23AA6NEV1 266 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CFHP08603 1231 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 TUSC3Q13454 348 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 FAM187BQ17R55 369 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 LILRA6Q6PI73 481 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 BSNDQ8WZ55 320 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 FZD8Q9H461 694 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.29■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PTGDRQ13258 359 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PDIA5Q14554 519 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 ECM1Q16610 540 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 NXPE3Q969Y0 559 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 WNT16Q9UBV4 365 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 KIF3AQ9Y496 699 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 VPS13AQ96RL7 3174 aa23.28■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 N4BP3O15049 544 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 RTP2Q5QGT7 225 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 HASPINQ8TF76 798 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 STK24Q9Y6E0 443 aa23.27■■□□□ 1.32
SOCS1-201ENST00000332029 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 STK25O00506 426 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 ZMYND10O75800 440 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 SRFP11831 508 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 NAMPTP43490 491 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 PPP2R5AQ15172 486 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 MAPK6Q16659 721 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 DTWD2Q8NBA8 298 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 DEPTORQ8TB45 409 aa23.26■■□□□ 1.31
SOCS1-201ENST00000332029 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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