RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 KAT5Q92993 513 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CAMTA2O94983 1202 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 GAP43P17677 238 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PGM1P36871 562 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CUL3Q13618 768 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 POMGNT1Q8WZA1 660 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MTMR9Q96QG7 549 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 KCNQ2O43526 872 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZBED4O75132 1171 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PPP2R5CQ13362 524 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CBWD6Q4V339 395 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF394Q53GI3 561 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CBWD3Q5JTY5 395 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CBWD5Q5RIA9 395 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 RNF220Q5VTB9 566 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 USP37Q86T82 979 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC125Q86Z20 511 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CHST7Q9NS84 486 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MRC1P22897 1456 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TRPA1O75762 1119 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 KRT1P04264 644 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 VAMP7P51809 220 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 NFIXQ14938 502 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 EPHA7Q15375 998 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SERPINB12Q96P63 405 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 INHBAP08476 426 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CD19P15391 556 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CALB2P22676 271 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MAGEA4P43358 317 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PEX3P56589 373 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 LAMB3Q13751 1172 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF384Q8TF68 577 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 HES6Q96HZ4 224 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 AFF2P51816 1311 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ATP9AO75110 1047 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TMED1Q13445 227 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 HAS1Q92839 578 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 VCX3BQ9H321 246 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TTC4O95801 387 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 RALAP11233 206 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 BMP3P12645 472 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ARSEP51690 589 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MAP7Q14244 749 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 CENPTQ96BT3 561 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TLCD1Q96CP7 247 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 HEY2Q9UBP5 337 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TISP43B9A030 160 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ITIH2P19823 946 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 STK32AQ8WU08 396 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 TRAIPQ9BWF2 469 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 C5orf60A6NFR6 353 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 UNC5CO95185 931 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 KRT4P19013 534 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF543Q08ER8 600 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRN1-201ENST00000319331 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms