RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314126.4

AKAP1-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP1, Length 2,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-201ENST00000314126 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.51■□□□□ 0.23
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AKAP1-201ENST00000314126 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.48■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
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AKAP1-201ENST00000314126 DEPTORQ8TB45 409 aa16.48■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.48■□□□□ 0.23
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AKAP1-201ENST00000314126 TRPC6Q9Y210 931 aa16.48■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 PPME1Q9Y570 386 aa16.48■□□□□ 0.23
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AKAP1-201ENST00000314126 TTI1O43156 1089 aa16.47■□□□□ 0.23
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AKAP1-201ENST00000314126 PEX5P50542 639 aa16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 14.1
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AKAP1-201ENST00000314126 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.47■□□□□ 0.23
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AKAP1-201ENST00000314126 ZNF677Q86XU0 584 aa16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 NRBP2Q9NSY0 501 aa16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 10.6
AKAP1-201ENST00000314126 NR2E1Q9Y466 385 aa16.47■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 K7ERI5 159 aa16.46■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 COMTP21964 271 aa16.46■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 CTNNA2P26232 953 aa16.46■□□□□ 0.23
AKAP1-201ENST00000314126 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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