RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297265.4

CHMP4C-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4C, Length 1,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4C-201ENST00000297265 EFNA5P52803 228 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 HUNKP57058 714 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 DPP9Q86TI2 863 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 VPS36Q86VN1 386 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 AGPAT1Q99943 283 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TINF2Q9BSI4 451 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TRPC6Q9Y210 931 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.68□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 H2AFZP0C0S5 128 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CCDC172P0C7W6 258 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PROZP22891 400 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CXCR5P32302 372 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TNFSF9P41273 254 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CLCN3P51790 818 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 H2AFVQ71UI9 128 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 USP37Q86T82 979 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PNKPQ96T60 521 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 FZD8Q9H461 694 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CPA4Q9UI42 421 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CYP26A1O43174 497 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PPFIA4O75335 1185 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TOM1L1O75674 476 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 FTCDO95954 541 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MAPK4P31152 587 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MFAP3P55082 362 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MORN1Q5T089 497 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CLDN3O15551 220 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF286BP0CG31 522 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TNFAIP3P21580 790 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PTENP60484 403 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 GCNT1Q02742 428 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MCL1Q07820 350 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ACVR2BQ13705 512 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 NT5C1BQ96P26 610 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PSMB7Q99436 277 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ISCUQ9H1K1 167 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 RAB21Q9UL25 225 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CENPFP49454 3210 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MGAMO43451 1857 aa14.66□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ACKR2O00590 384 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 B4GALT5O43286 388 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 PRKCBP05771 671 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TNNI1P19237 187 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TUBB4BP68371 445 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 MAPK6Q16659 721 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 FNBP1Q96RU3 617 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 ARID3AQ99856 593 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms