RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283415.3

LPCAT1-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT1, Length 3,966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1-201ENST00000283415 ZNF233A6NK53 670 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PLA2G6O60733 806 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 STX2P32856 288 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SESN3P58005 492 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 LMO3Q8TAP4 145 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ATG4CQ96DT6 458 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SLITRK3O94933 977 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SGO2Q562F6 1265 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CCDC63Q8NA47 563 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 WDR91A4D1P6 747 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 THAP12O43422 761 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CPP00450 1065 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 DPEP1P16444 411 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ZBTB16Q05516 673 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 HES6Q96HZ4 224 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SNCBQ16143 134 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 TMEM270Q6UE05 265 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 IL31RAQ8NI17 732 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NLRP4Q96MN2 994 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 VCPKMTQ9H867 229 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PPATQ06203 517 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.054e-8■■□□□ 13
LPCAT1-201ENST00000283415 NUP85Q9BW27 656 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NEK9Q8TD19 979 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 FBF1Q8TES7 1133 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 TRPC6Q9Y210 931 aa14.74□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ERVK-9P63128 1117 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PPP2R2AP63151 447 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 BFSP1Q12934 665 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PBKQ96KB5 322 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 EPN3Q9H201 632 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 LCTP09848 1927 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ENTPD3O75355 529 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SGPL1O95470 568 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 MFAP3P55082 362 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CCDC6Q16204 474 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 ALG6Q9Y672 507 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 CLDN3O15551 220 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 NEBLO76041 1014 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 RPTORQ8N122 1335 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 30.1
LPCAT1-201ENST00000283415 CNTNAP1P78357 1384 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PSMD1Q99460 953 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 F5H423 210 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 K7ERI5 159 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 RASGRF2O14827 1237 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 PTGISQ16647 500 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LPCAT1-201ENST00000283415 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms