RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259056.4

GALNT5-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT5, Length 6,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT5-201ENST00000259056 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 YY1AP1Q9H869 796 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 LCMT1Q9UIC8 334 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 H3BRJ5 948 aa7□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 MCF2P10911 925 aa7□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 ATL2Q8NHH9 583 aa7□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 A2ML1A8K2U0 1454 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 BEST2Q8NFU1 509 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 SLC10A4Q96EP9 437 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 FAM96AQ9H5X1 160 aa7□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 ACOT2P49753 483 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 DEUP1Q05D60 604 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 MTM1Q13496 603 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 IFT43Q96FT9 208 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.295e-8■■■□□ 16.8
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GALNT5-201ENST00000259056 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 EHD2Q9NZN4 543 aa6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 TTC8Q8TAM2 541 aa6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 STXBP3O00186 592 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 COPB2P35606 906 aa6.99□□□□□ -1.29
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GALNT5-201ENST00000259056 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 PID1Q7Z2X4 250 aa6.99□□□□□ -1.29
GALNT5-201ENST00000259056 RNF149Q8NC42 400 aa6.99□□□□□ -1.29
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