RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 CYP24A1Q07973 514 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 AADACL2Q6P093 401 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 ARL8AQ96BM9 186 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 HVCN1Q96D96 273 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 SH3GL2Q99962 352 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 MAF1Q9H063 256 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 ISCUQ9H1K1 167 aa20.15■□□□□ 0.82
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.15■□□□□ 0.82
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PDLIM4-201ENST00000253754 PMM2O15305 246 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP4AP20648 1035 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 NNTQ13423 1086 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 SHC3Q92529 594 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 TATDN2Q93075 761 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM143Q96AN5 459 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXL18Q96ME1 805 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 HSF2BPO75031 334 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 MARCKSL1P49006 195 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 GNPTABQ3T906 1256 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 TTMPQ5BVD1 217 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 SV2AQ7L0J3 742 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 DNERQ8NFT8 737 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 RAB20Q9NX57 234 aa20.14■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 ALG6Q9Y672 507 aa20.14■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT14P02533 472 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 CETPP11597 493 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 MFAP3P55082 362 aa20.13■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT35Q92764 455 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 CDHR1Q96JP9 859 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.13■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 TTI1O43156 1089 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC25A27O95847 323 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ACTN2P35609 894 aa20.13■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 GPD1LQ8N335 351 aa20.13■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.13■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ARID2Q68CP9 1835 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 PDHXO00330 501 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 CYP11B1P15538 503 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 GPC5P78333 572 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 STXBP2Q15833 593 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ALS2CLQ60I27 953 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 IFT74Q96LB3 600 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 NT5C1BQ96P26 610 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 RUFY1Q96T51 708 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 PNMA3Q9UL41 463 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 WDR81Q562E7 1941 aa20.12■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 BTBD19C9JJ37 291 aa20.11■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 RTN2O75298 545 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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PDLIM4-201ENST00000253754 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF516Q92618 1163 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF233A6NK53 670 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC188H7C350 402 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 PGK2P07205 417 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 MESDQ14696 234 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 XKR3Q5GH77 459 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 IQCKQ8N0W5 287 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF302Q9NR11 478 aa20.11■□□□□ 0.81
PDLIM4-201ENST00000253754 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.1■□□□□ 0.81
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