RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gimap3Q99MI6 301 aa27.73■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ergic2Q9CR89 377 aa27.73■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 FdxrQ61578 494 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Phlda1Q62392 405 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Frmd3Q8BHD4 595 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dusp19Q8K4T5 220 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 AdigQ8R400 80 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm10110D3Z5M2 615 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plekha5E9Q6H8 1269 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nck2O55033 380 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Hoxc8P09025 242 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gjb6P70689 261 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 BC051142Q3V0M8 400 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mapk6Q61532 720 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lamtor4Q8CF66 99 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ap3m2Q8R2R9 418 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Q922R1 422 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa27.72■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gon4lQ9DB00 2260 aa27.71■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Maats1Q8BRC6 783 aa27.71■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc26a6Q8CIW6 758 aa27.71■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa27.71■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Irx4Q9QY61 515 aa27.71■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 FancbQ5XJY6 703 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pacsin1Q61644 441 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Olfr1499Q8VG65 314 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam187aQ9D3R5 417 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rnf25Q9QZR0 456 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 SrcapA0A087WQ44 3271 aa27.7■■■□□ 2.03
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Arid2E9Q7E2 1828 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pla2g4aP47713 748 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Phactr1Q2M3X8 580 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Znf865Q3U3I9 1058 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Q3UK37 420 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Psmd5Q8BJY1 504 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Elmo3Q8BYZ7 720 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 TtpalQ9D3D0 343 aa27.7■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sclt1G5E861 688 aa27.69■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Aoc3O70423 765 aa27.69■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rnf113a2Q14B01 337 aa27.69■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa27.69■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ankrd16A2AS55 361 aa27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Olfr552E9Q545 317 aa27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nxf2Q4ZGD8 691 aa27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Q6PD19 689 aa27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tcaf3Q6QR59 914 aa27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MesdQ9ERE7 224 aa27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tnfrsf18O35714 228 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mmp3P28862 477 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trim72Q1XH17 477 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dsg1aQ61495 1057 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Klhl17Q6TDP3 640 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zbed4Q80WQ9 1168 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Micall1Q8BGT6 870 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kct2Q8K201 259 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Klhl36Q8R124 613 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CalcbQ99MP3 130 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ptchd4B9EKX1 904 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Polr2fP61219 127 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Q5XFZ0 217 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Elf1Q60775 612 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Snx17Q8BVL3 470 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 VillQ91YD6 859 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NapgQ9CWZ7 312 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa27.67■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Prdm12A2AJ77 365 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tnnc2P20801 160 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gna15P30678 374 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nub1P54729 614 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Hace1Q3U0D9 909 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp2c29Q64458 490 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Taf2Q8C176 1104 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Hgh1Q8C3I8 393 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lrrc57Q9D1G5 239 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Adam22Q9R1V6 904 aa27.66■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa27.65■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gucy1b3O54865 620 aa27.65■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NeblQ0II04 452 aa27.65■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa27.65■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tspan18Q80WR1 248 aa27.65■■■□□ 2.02
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Phka2Q8BWJ3 1235 aa27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms