RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp1a4Q9WV27 1032 aa20.32■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prr14lE9Q7C4 1971 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa20.3■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm3453K7N724 263 aa20.3■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pdk2Q9JK42 407 aa20.3■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm4297D3YWB7 211 aa20.3■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nfe2Q07279 373 aa20.3■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mgat3Q10470 538 aa20.3■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Snx19Q6P4T1 997 aa20.3■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa20.3■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Klhl33G3UW92 533 aa20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf367Q0VDT2 340 aa20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc157Q5SPX1 718 aa20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Frmd5Q6P5H6 517 aa20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gtpbp10Q8K013 366 aa20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GldcQ91W43 1025 aa20.29■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Morc1Q9WVL5 950 aa20.29■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Samd1D3YXK1 519 aa20.28■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Chrna1P04756 457 aa20.28■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AdkP55264 361 aa20.28■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vamp7P70280 220 aa20.28■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp6nlQ80XC3 819 aa20.28■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rassf4Q8CB96 322 aa20.28■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Olfr1499Q8VG65 314 aa20.28■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp2c2A7L9Z8 944 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sptlc1O35704 473 aa20.27■□□□□ 0.84
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Phka1P18826 1241 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mgat1P27808 447 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim37Q6PCX9 961 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Elmo3Q8BYZ7 720 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc15a5Q8CBB2 566 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ctage5Q8R311 779 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Golph3Q9CRA5 298 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Msgn1Q9JK54 188 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Angptl3Q9R182 455 aa20.27■□□□□ 0.84
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Calcoco2A2A6M5 331 aa20.27■□□□□ 0.83
Ldb1-201ENSMUST00000026252 4933406M09RikG3XA12 479 aa20.27■□□□□ 0.83
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ZfxP17012 799 aa20.27■□□□□ 0.83
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