RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P PIN3Q06449 215 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TPO3Q06451 622 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM6Q07716 390 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P LOT6Q07923 191 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ERP4Q12450 207 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.21□□□□□ -2.06not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P SCEIP03882 235 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SGA1P08019 549 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MET3P08536 511 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YML003WP0CF16 290 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PMR1P13586 950 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YAK1P14680 807 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPS28P21771 286 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FPS1P23900 669 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P OAC1P32332 324 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MRT4P33201 236 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SUR1P33300 382 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FRM2P37261 193 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FAT1P38225 669 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SLM4P38247 162 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX32P38292 413 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PIC2P40035 300 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FMC1P40491 155 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AGP3P43548 558 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P CIN2P46670 268 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PPT1P53043 513 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD17P53727 317 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL046WP53956 172 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG5,6Q01217 863 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PRM15Q03262 622 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YMD8Q03697 442 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GMC1Q04399 608 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR514CQ04408 483 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR317WQ04893 1140 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MRX8Q05473 314 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FCY22Q12119 530 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL009CQ12210 107 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PCL9Q12477 304 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RIB3Q99258 208 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P REP2P03872 296 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO80P20052 293 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P APA2P22108 325 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL5P26321 297 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P APE2P32454 952 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NDC1P32500 655 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P DOA4P32571 926 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SHE1P38200 338 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR096WP38256 230 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SIC1P38634 284 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR035WP38769 630 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MDM31P38880 579 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P IPT1P38954 527 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RMD6P39975 231 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P HIS6P40545 261 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PAM16P42949 149 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P CTK2P46962 323 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL186WP48568 277 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PHB2P50085 310 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P COS10P52924 374 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GEP7P53171 287 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ERP6P53198 216 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR048WP53740 393 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P WSC2P53832 503 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YDC1Q02896 317 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR391CQ04170 232 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SMP3Q04174 516 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P CAC2Q04199 468 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MLC2Q06580 163 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR196WQ06595 470 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SRL1Q08673 210 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SIA1Q12212 622 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR029WQ12243 111 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.2□□□□□ -2.06not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P BPH1P25356 2167 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL25P04456 142 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P TPK3P05986 398 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SIR2P06700 562 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NAM2P11325 894 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ATR1P13090 542 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ENA1P13587 1091 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.1 ms