RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K PIN3Q06449 215 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TPO3Q06451 622 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM6Q07716 390 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K LOT6Q07923 191 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ERP4Q12450 207 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.21□□□□□ -2.06not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SCEIP03882 235 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SGA1P08019 549 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MET3P08536 511 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YML003WP0CF16 290 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PMR1P13586 950 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YAK1P14680 807 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPS28P21771 286 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FPS1P23900 669 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K OAC1P32332 324 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MRT4P33201 236 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SUR1P33300 382 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FRM2P37261 193 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FAT1P38225 669 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SLM4P38247 162 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX32P38292 413 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PIC2P40035 300 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FMC1P40491 155 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K AGP3P43548 558 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K CIN2P46670 268 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PPT1P53043 513 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K BUD17P53727 317 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL046WP53956 172 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K ARG5,6Q01217 863 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM15Q03262 622 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YMD8Q03697 442 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K GMC1Q04399 608 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR514CQ04408 483 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR317WQ04893 1140 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MRX8Q05473 314 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FCY22Q12119 530 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL009CQ12210 107 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PCL9Q12477 304 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RIB3Q99258 208 aa2.21□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K REP2P03872 296 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO80P20052 293 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K APA2P22108 325 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL5P26321 297 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K APE2P32454 952 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K NDC1P32500 655 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K DOA4P32571 926 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SHE1P38200 338 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR096WP38256 230 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SIC1P38634 284 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR035WP38769 630 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM31P38880 579 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K IPT1P38954 527 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RMD6P39975 231 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K HIS6P40545 261 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PAM16P42949 149 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K CTK2P46962 323 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL186WP48568 277 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PHB2P50085 310 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K COS10P52924 374 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K GEP7P53171 287 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K ERP6P53198 216 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR048WP53740 393 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K WSC2P53832 503 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YDC1Q02896 317 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR391CQ04170 232 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SMP3Q04174 516 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K CAC2Q04199 468 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K MLC2Q06580 163 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR196WQ06595 470 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SRL1Q08673 210 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SIA1Q12212 622 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR029WQ12243 111 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.2□□□□□ -2.06not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K BPH1P25356 2167 aa2.2□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL25P04456 142 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K TPK3P05986 398 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K SIR2P06700 562 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K NAM2P11325 894 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K ATR1P13090 542 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K ENA1P13587 1091 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)KtW(CCA)K FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
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