RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	YKL162C	P36052	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MRPL37	P36532	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MAL32	P38158	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SDH8	P38345	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	LNP1	P38878	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PHO90	P39535	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	OSW5	P40219	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YIL024C	P40543	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	GTT1	P40582	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CAF16	P43569	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MRX5	P47007	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TAD2	P47058	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	FMP48	P53233	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	RSM27	P53305	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MAL12	P53341	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
YKR041W	YKR041W	ODC1	Q03028	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	BNA7	Q04066	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TMN2	Q04562	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CYK3	Q07533	885 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	AIM6	Q07716	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YOS9	Q99220	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ISN1	Q99312	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CDC7	P06243	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PHO2	P07269	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YCR100C	P25606	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PRO1	P32264	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MCM10	P32354	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YEF1	P32622	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	AFR1	P33304	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	COS9	P36034	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CHK1	P38147	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SEN34	P39707	275 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	VPS52	P39904	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TOK1	P40310	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	AZF1	P41696	914 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	POP1	P41812	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YJR120W	P47157	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	VEL1	P53058	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MTM1	P53320	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	INN1	P53901	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ROT1	Q03691	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SNO4	Q04902	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TDA6	Q06466	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	HSP32	Q08992	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	KIN28	P06242	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PBN1	P25580	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	BUB3	P26449	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	REC104	P33323	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	GPX1	P36014	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YKL071W	P36086	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CDS1	P38221	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PEX32	P38292	413 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SDS24	P38314	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TRR2	P38816	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PUG1	P40100	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MOB1	P40484	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	BUL1	P48524	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SGF73	P53165	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CTF19	Q02732	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	NNT1	Q05874	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	CDA2	Q06703	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TMS1	Q12116	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	PRB1	P09232	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR041W	YKR041W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR041W	YKR041W	NAM2	P11325	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR041W	YKR041W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR041W	YKR041W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.3 ms