RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MTR10	Q99189	972 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CDC21	P06785	304 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ATS1	P31386	333 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	UBC12	P52491	188 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MPS2	P53159	387 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	NDD1	Q08887	554 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	APC2	Q12440	853 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	HIP1	P06775	603 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	MNE1	P24720	663 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	OAC1	P32332	324 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	CSE2	P33308	149 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SIF2	P38262	535 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YHR035W	P38769	630 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	GEP4	P38812	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	SSO2	P39926	295 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	RPR2	P40571	144 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	GDS1	P41913	522 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	PAM16	P42949	149 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	NBP35	P52920	328 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	POP6	P53218	158 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	BUR2	Q05949	395 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	APC5	Q08683	685 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PRD1	YCL057W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	POX1	P13711	748 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PHO80	P20052	293 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PMT2	P31382	759 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	ACB1	P31787	87 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SRY1	P36007	326 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	BMT2	P38278	337 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	STP2	P38704	541 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	RRF1	P38771	230 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SHO1	P40073	367 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	FMC1	P40491	155 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YGR026W	P53217	278 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PRM15	Q03262	622 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	TRM82	Q03774	444 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	MHT1	Q12525	324 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YOS9	Q99220	542 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	STT4	P37297	1900 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SCEI	P03882	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	CPR3	P25719	182 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
PRD1	YCL057W	ECM25	P32525	599 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PHB1	P40961	287 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	COS10	P52924	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PNG1	Q02890	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SPO77	Q06134	477 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	ASR1	Q06834	288 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	AYT1	Q12226	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SIR2	P06700	562 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	MER1	P16523	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SSN8	P47821	323 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	COS1	P53822	381 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	VHS1	Q03785	461 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	GPN3	Q06543	272 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	PST1	Q12355	444 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	TFS1	P14306	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	VAM7	P32912	316 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	YNL143C	P53908	130 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PRD1	YCL057W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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