RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 INPPL1O15357 1258 aa24.6■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 DDIT3P35638 169 aa24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 SLC11A1P49279 550 aa24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 SCNN1GP51170 649 aa24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 BECN1Q14457 450 aa24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 MCM6Q14566 821 aa24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 USP49Q70CQ1 688 aa24.6■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.6■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 SLC16A4O15374 487 aa24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 CA8P35219 290 aa24.59■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 COL19A1Q14993 1142 aa24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 KLK14Q9P0G3 267 aa24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 STK39Q9UEW8 545 aa24.59■■□□□ 1.53
SYT6-210ENST00000641643 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.59■■□□□ 1.53
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SYT6-210ENST00000641643 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.58■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 VPS52Q8N1B4 723 aa24.58■■□□□ 1.52
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SYT6-210ENST00000641643 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
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SYT6-210ENST00000641643 LINC01565O15544 149 aa24.55■■□□□ 1.52
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SYT6-210ENST00000641643 DSC1Q08554 894 aa24.55■■□□□ 1.52
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SYT6-210ENST00000641643 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.55■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.55■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 YEATS4O95619 227 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 CXCL14O95715 111 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 SV2BQ7L1I2 683 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 STAT6P42226 847 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 PKP1Q13835 747 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 ATL3Q6DD88 541 aa24.54■■□□□ 1.52
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