RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640393.1

RTTN-217, Transcript of rotatin, humanhuman

TSL 5

Gene RTTN, Length 1,357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTTN-217ENST00000640393 IL17RAQ96F46 866 aa7.33□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 LRGUKQ96M69 825 aa7.33□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.33□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.33□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 GZMKP49863 264 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 KRT85P78386 507 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MST1LQ2TV78 715 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TPH2Q8IWU9 490 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MB21D1Q8N884 522 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 OR7D4Q8NG98 312 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 KAT5Q92993 513 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 C8orf49Q96NF6 230 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CSRNP2Q9H175 543 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.32□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PATE3B3GLJ2 98 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 COMTP21964 271 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SREBF1P36956 1147 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HHEXQ03014 270 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MGAT2Q10469 447 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CEP95Q96GE4 821 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 BCO1Q9HAY6 547 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.31□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CAPN14A8MX76 684 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 WNT10BO00744 389 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ENDOD1O94919 500 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 GASTP01350 101 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HK1P19367 917 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 EDNRBP24530 442 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CRHR1P34998 444 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SLC6A9P48067 706 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PPP2R5AQ15172 486 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ANKS6Q68DC2 871 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 RSPH3Q86UC2 560 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PALM2Q8IXS6 379 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HDAC10Q969S8 669 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PGBD4Q96DM1 585 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ADOQ96SZ5 270 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SPON1Q9HCB6 807 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 IPPQ9Y573 584 aa7.3□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MFAP3LO75121 409 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ABLIM3O94929 683 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 RAP2AP10114 183 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 GNAT2P19087 354 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 PDCP20941 246 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HS1BP3Q53T59 392 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 CHPFQ8IZ52 775 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.29□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 FPR1P21462 350 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TMEM240Q5SV17 173 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 Q6ZSN1 163 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 DNERQ8NFT8 737 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SAMD11Q96NU1 681 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 LANCL2Q9NS86 450 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TDP1Q9NUW8 608 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.28□□□□□ -1.24
RTTN-217ENST00000640393 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 E2F8A0AVK6 867 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 RAP2BP61225 183 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 AFMIDQ63HM1 303 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms