RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3D21	A4FU49	640 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD51B	O15315	384 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ITGA2B	P08514	1039 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	LRPAP1	P30533	357 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SOX6	P35712	828 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	THOP1	P52888	689 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CACNA2D1	P54289	1103 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	USP14	P54578	494 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	RCN2	Q14257	317 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CYTH1	Q15438	398 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF124	Q15973	351 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ANO5	Q75V66	913 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SEPT8	Q92599	483 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	INPP5D	Q92835	1189 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GMIP	Q9P107	970 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A087WWV3	80 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	BIRC5	O15392	142 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KLHL2	O95198	593 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KRT7	P08729	469 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FGR	P09769	529 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	HSMCR30	P0CW71	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	DIO1	P49895	249 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TUB	P50607	506 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TMPRSS15	P98073	1019 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ALS2CL	Q60I27	953 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	POF1B	Q8WVV4	589 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NXPE3	Q969Y0	559 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	UCN2	Q96RP3	112 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	EYA1	Q99502	592 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SENP1	Q9P0U3	644 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SERTM1	A2A2V5	107 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP6V1C1	P21283	382 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	IL10	P22301	178 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ADH7	P40394	386 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	GALK1	P51570	392 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	GTF2A2	P52657	109 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	FUT2	Q10981	343 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	NR1D2	Q14995	579 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	CD302	Q8IX05	232 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	LINS1	Q8NG48	757 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	HINFP	Q9BQA5	517 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	STK32B	Q9NY57	414 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	MED16	Q9Y2X0	877 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	MEN1	O00255	615 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ADCY3	O60266	1144 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	DTNB	O60941	627 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	PRL	P01236	227 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	GLI1	P08151	1106 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	FECH	P22830	423 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	PHB	P35232	272 aa		6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
NECAP1-222	ENST00000640072	ZAP70	P43403	619 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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