RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFHB	Q8N7U6	833 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAD54L	Q92698	747 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPSTI1	Q96J88	318 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP42	Q96MM3	310 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNTG2	Q9NY99	539 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRP1	O14786	923 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FSCN2	O14926	492 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM13A	O94988	1023 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDIT3	P35638	169 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAPK7	Q13164	816 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GIT2	Q14161	759 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCM6	Q14566	821 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL19A1	Q14993	1142 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLIC6	Q96NY7	704 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MIOS	Q9NXC5	875 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		18.22	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	INPPL1	O15357	1258 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01565	O15544	149 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIK3	Q13003	919 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLUL1	Q15846	466 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUSP6	Q16828	381 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYCT1	Q8N699	235 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK17A	Q9UEE5	414 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD207	Q9UJ71	328 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GDA	Q9Y2T3	454 aa		18.21	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIDE1	A8MVS5	230 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFRSF10A	O00220	468 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPTLC2	O15270	562 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	RECQL4	O94761	1208 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LTBR	P36941	435 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARSH	Q5FYA8	562 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	BICD1	Q96G01	975 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	REEP2	Q9BRK0	252 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARVG	Q9HBI0	331 aa		18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRANK1	O15050	2925 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	F13A1	P00488	732 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	EDN1	P05305	212 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TH	P07101	528 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTSA	P10619	480 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCP2	P22307	547 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	18.19	■□□□□ 0.5	3e-7	■■■■□ 25.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP49	Q70CQ1	688 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SV2B	Q7L1I2	683 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB33	Q86T24	672 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBP1	Q9H171	429 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		18.19	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO7A	Q13402	2215 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	B4GALT3	O60512	393 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP6R2	O75170	966 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBX10	O75333	385 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	YEATS4	O95619	227 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL9	P15248	144 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	STAT6	P42226	847 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	DSC1	Q08554	894 aa		18.18	■□□□□ 0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		18.18	■□□□□ 0.5

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