RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 GINS2Q9Y248 185 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 STK36Q9NRP7 1315 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf58C9J3I9 102 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ACAP3Q96P50 834 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PARVAQ9NVD7 372 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GPC5P78333 572 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA21Q7Z572 469 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD7Q92527 254 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ATP7BP35670 1465 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM25AB3EWG3 89 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM25CB3EWG5 89 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM25GB3EWG6 89 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 POTEIP0CG38 1075 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 STAT4Q14765 748 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 STK32BQ9NY57 414 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 EPHB1P54762 984 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PTCH1Q13635 1447 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 APOL4Q9BPW4 351 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GINM1Q9NU53 330 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SOX13Q9UN79 622 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 VCAM1P19320 739 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SH3GL1Q99961 368 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RUBCNLQ9H714 662 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CASZ1Q86V15 1759 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SMAPO00193 183 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RIMBP2O15034 1052 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TTLL1O95922 423 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 USP44Q9H0E7 712 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZW10O43264 779 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R37O75864 691 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ITGA1P56199 1179 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DSG1Q02413 1049 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 APPL2Q8NEU8 664 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ERBB4Q15303 1308 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PPIP5K2O43314 1243 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BCAP31P51572 246 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KYAT1Q16773 422 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 AMNQ9BXJ7 453 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRT-209ENST00000612229 CSADQ9Y600 493 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 H3BMM5 538 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNA2Q15822 529 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RAPGEF5Q92565 580 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 VPS33AQ96AX1 596 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ULK4Q96C45 1275 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TAF4O00268 1085 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DYRK3O43781 588 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LSP1P33241 339 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 IL17RAQ96F46 866 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BMP10O95393 424 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ATP10BO94823 1461 aa7.35□□□□□ -1.23
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