RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590977.5

EFTUD2-219, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 2,422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-219ENST00000590977 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 TRIM58Q8NG06 486 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ARL8AQ96BM9 186 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ACCSQ96QU6 501 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ELP3Q9H9T3 547 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 MAFGO15525 162 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.792e-7■□□□□ 10.2
EFTUD2-219ENST00000590977 KLRC1P26715 233 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 MDH1P40925 334 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 NCKAP1LP55160 1127 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ACTR2P61160 394 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 BFSP1Q12934 665 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 E2F5Q15329 346 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GADL1Q6ZQY3 521 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CD302Q8IX05 232 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM206Q9H813 350 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 FBXL5Q9UKA1 691 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PFASO15067 1338 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 MYPNQ86TC9 1320 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GOLGA8JA6NMD2 632 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CCDC169A6NNP5 214 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 AHCYL1O43865 530 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ZMYND10O75800 440 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GFPT2O94808 682 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 FESP07332 822 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GHRP10912 638 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 NPTX2P47972 431 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PPP3CAQ08209 521 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 RIPK1Q13546 671 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ABHD15Q6UXT9 468 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 LBX2Q6XYB7 198 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ARMC9Q7Z3E5 817 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 SULF1Q8IWU6 871 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 RDM1Q8NG50 284 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 OLIG1Q8TAK6 271 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 LMO3Q8TAP4 145 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 OTUD5Q96G74 571 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CEP170P1Q96L14 293 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PSMB7Q99436 277 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 SNX12Q9UMY4 172 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 NFASCO94856 1347 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ADRB2P07550 413 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 NR1D1P20393 614 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ADSSP30520 456 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CXCR5P32302 372 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PRKCIP41743 596 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 RAB27AP51159 221 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 MYL7Q01449 175 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ALCAMQ13740 583 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 NAB2Q15742 525 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CYFIP1Q7L576 1253 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CAGE1Q8TC20 777 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 OSBPL9Q96SU4 736 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 GPR88Q9GZN0 384 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 DNAJC12Q9UKB3 198 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 TBX20Q9UMR3 447 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 TRPC6Q9Y210 931 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 CSADQ9Y600 493 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 EMSYQ7Z589 1322 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 FAM170AA1A519 330 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 AP1G2O75843 785 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 ATP6V1G2O95670 118 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 PSAPP07602 524 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-219ENST00000590977 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms