RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 KCND2Q9NZV8 630 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PARP2Q9UGN5 583 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 NR1I2O75469 434 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 OR1G1P47890 313 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 NPTX2P47972 431 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PEX3P56589 373 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 MAPK7Q13164 816 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CASP10Q92851 521 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 S1PR5Q9H228 398 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.24■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC169A6NNP5 214 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 EDN1P05305 212 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 LIG1P18858 919 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SYT1P21579 422 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 GRIK3Q13003 919 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CABP7Q86V35 215 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 MARCH5Q9NX47 278 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 KLK14Q9P0G3 267 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 USP20Q9Y2K6 914 aa22.23■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 EFEMP2O95967 443 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CA8P35219 290 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 UBA7P41226 1012 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SLC12A3P55017 1021 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PTPN14Q15678 1187 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SUSD6Q92537 303 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PLIN2Q99541 437 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TRIP11Q15643 1979 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 LILRB3O75022 631 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SOD2P04179 222 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PLA2G4BP0C869 781 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 CALML4Q96GE6 196 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SNTG2Q9NY99 539 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.21■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 SNX21Q969T3 373 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.2■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 SFI1A8K8P3 1242 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 RECQL4O94761 1208 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 ALADP13716 330 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 PLS3P13797 630 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 RESTQ13127 1097 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 TUSC3Q13454 348 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 PTPAQ15257 358 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.19■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 PTGESO14684 152 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 THP07101 528 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 SMTNP53814 917 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 GRIN1Q05586 938 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 ITIH3Q06033 890 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 ARSHQ5FYA8 562 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.18■■□□□ 1.14
GIPC1-211ENST00000589631 GPR65Q8IYL9 337 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms