RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	SOD2	P04179	222 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	EPCAM	P16422	314 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	NAMPT	P43490	491 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	KIFAP3	Q92845	792 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	FZD8	Q9H461	694 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	KLK14	Q9P0G3	267 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	DNM3	Q9UQ16	869 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	PRKCB	P05771	671 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	PLA2G5	P39877	138 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM187B	Q17R55	369 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	MIOS	Q9NXC5	875 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	MCM2	P49736	904 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	TMX3	Q96JJ7	454 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SMAD2-208	ENST00000587269	EFNA5	P52803	228 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ZXDA	P98168	799 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	DSC1	Q08554	894 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	GRIK3	Q13003	919 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	FBXL18	Q96ME1	805 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	DPP7	Q9UHL4	492 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ACKR2	O00590	384 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	GLUD2	P49448	558 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ECM1	Q16610	540 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	BSND	Q8WZ55	320 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TADA2A	O75478	443 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ADH1A	P07327	375 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	WEE2	P0C1S8	567 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	GJB2	P29033	226 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	PRPH	P41219	470 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	POMK	Q9H5K3	350 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	POLD4	Q9HCU8	107 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	MARCH5	Q9NX47	278 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	CDH22	Q9UJ99	828 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM221	A6NGB7	291 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC169	A6NNP5	214 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269		K7ERI5	159 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269		M0R296	226 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	CLCN4	P51793	760 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	SNTG2	Q9NY99	539 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	LILRB3	O75022	631 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SMAD2-208	ENST00000587269		E9PMD0	336 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	TH	P07101	528 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	PTPN21	Q16825	1174 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	USP41	Q3LFD5	358 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	KANK3	Q6NY19	840 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	TUSC3	Q13454	348 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	FUT10	Q6P4F1	479 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	DRC1	Q96MC2	740 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	PP2D1	A8MPX8	630 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	GLUD1	P00367	558 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	CDC25A	P30304	524 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	PEX3	P56589	373 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	DSG1	Q02413	1049 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SMAD2-208	ENST00000587269	USP20	Q9Y2K6	914 aa		32.49	■■■□□ 2.79

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