RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	AKAP5	P24588	427 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ZPBP2	Q6X784	338 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CDT1	Q9H211	546 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	GDA	Q9Y2T3	454 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CLDN3	O15551	220 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R37	O75864	691 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	OSTN	P61366	133 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	URGCP	Q8TCY9	931 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	SNTG2	Q9NY99	539 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	LAMA3	Q16787	3333 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	SMC2	O95347	1197 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	KCNA1	Q09470	495 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	FAM161B	Q96MY7	647 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	RNF39	Q9H2S5	420 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CERS4	Q9HA82	394 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	RNF19A	Q9NV58	838 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01553	A4QN01	128 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF15	O94989	841 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MCF2	P10911	925 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MLH1	P40692	756 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	KCNN1	Q92952	543 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCE1	Q969G3	411 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	KLK14	Q9P0G3	267 aa		27.28	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	TISP43	B9A030	160 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PIGR	P01833	764 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PROZ	P22891	400 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	EHHADH	Q08426	723 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PSMD2	Q13200	908 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC43	Q8N309	656 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CEP120	Q8N960	986 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	CASD1	Q96PB1	797 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	STRA6	Q9BX79	667 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM206	Q9H813	350 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	UBE4B	O95155	1302 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	RECQL4	O94761	1208 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	TAP1	Q03518	808 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	SEZ6	Q53EL9	994 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	GAD1	Q99259	594 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	GBP3	Q9H0R5	595 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF576	Q9H609	170 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	RMND1	Q9NWS8	449 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	HCST	Q9UBK5	93 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	OFD1	O75665	1012 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	POMC	P01189	267 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	CTNNB1	P35222	781 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	STK4	Q13043	487 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	CAMK4	Q16566	473 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	SPRED2	Q7Z698	418 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP42	Q96MM3	310 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ANK1	P16157	1881 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ARL5C	A6NH57	179 aa		27.24	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	ABLIM1	O14639	778 aa		27.24	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	RHOBTB3	O94955	611 aa		27.24	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	GRM5	P41594	1212 aa		27.24	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	MCL1	Q07820	350 aa		27.24	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		27.24	■■□□□ 1.95
GPS1-223	ENST00000584229	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	27.24	■■□□□ 1.95

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