RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 PSMA5P28066 241 aa14.88□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 LILRA6Q6PI73 481 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.88□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 C4orf19Q8IY42 314 aa14.88□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 FOXQ1Q9C009 403 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CSRNP2Q9H175 543 aa14.88□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.88□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 DEXIO95424 95 aa14.87□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 LXNQ9BS40 222 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.87□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 ZNF292O60281 2723 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 EML1O00423 815 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CPLX1O14810 134 aa14.86□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 RPS6KB1P23443 525 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 HOXA9P31269 272 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PTENP60484 403 aa14.86□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 XKR9Q5GH70 373 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PDXDC1Q6P996 788 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.86□□□□□ -0.03
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COPS3-218ENST00000584216 APOL6Q9BWW8 343 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 RNF39Q9H2S5 420 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 VAV3Q9UKW4 847 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 HES2Q9Y543 173 aa14.86□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 M0R2N6 131 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 TBX3O15119 743 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 SLC37A4O43826 429 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 GLULP15104 373 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 EVCP57679 992 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 ARHGAP8P85298 464 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 LMNB2Q03252 620 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 EPHA7Q15375 998 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 INF2Q27J81 1249 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 PARM1Q6UWI2 310 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 DCLK2Q8N568 766 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 FGF14Q92915 247 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CPB2Q96IY4 423 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 B3GALT6Q96L58 329 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 NELL2Q99435 816 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.85□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 POTEMA6NI47 508 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 F8W810 466 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 C8AP07357 584 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 POU2F2P09086 479 aa14.84□□□□□ -0.03
COPS3-218ENST00000584216 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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