RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB33Q86T24 672 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 M0QZ92 97 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACOT2P49753 483 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTK7Q13308 1070 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYCP1Q15431 976 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARMC5Q96C12 935 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOD1Q9Y239 953 aa25.46■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1B0GUA9 196 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM189A1O60320 539 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 FGFR4P22455 802 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 DLG4P78352 724 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYP24A1Q07973 514 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARVCFO00192 962 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 OGTO15294 1046 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 ENPEPQ07075 957 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMC2Q8TDI7 906 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPB2Q96IY4 423 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM49P0CI25 452 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM49CP0CI26 452 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 GSDMDP57764 484 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP37Q86T82 979 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDT1Q9H211 546 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.44■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 SGPL1O95470 568 aa25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHRNA1P02708 482 aa25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 THPOP40225 353 aa25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNMA1Q12791 1236 aa25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.43■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 FMO5P49326 533 aa25.42■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLK7P49862 253 aa25.42■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 B4GALT4O60513 344 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCF2P10911 925 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDK7P50613 346 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 MGAT3Q09327 533 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMD6Q15008 389 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEZ6Q53EL9 994 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUP58Q9BVL2 599 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 GYPCP04921 128 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTSHP09668 335 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 AXLP30530 894 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFSF9P41273 254 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP3CAQ08209 521 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBL2Q08999 1139 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM14Q14142 442 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBWD6Q4V339 395 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 HS1BP3Q53T59 392 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.41■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLDN10P78369 228 aa25.4■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.4■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADPGKQ9BRR6 497 aa25.4■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.4■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 STX10O60499 249 aa25.39■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAND2O75155 1236 aa25.39■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARID5BQ14865 1188 aa25.39■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.39■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 FIGNQ5HY92 759 aa25.39■■□□□ 1.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOTUMQ6P988 496 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms