RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 PRORYQ9H606 182 aa2.76□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 C1orf115Q9H7X2 142 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 JMJD4Q9H9V9 463 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa2.76□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 ATG13O75143 517 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 XYLBO75191 536 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 ZNF484Q5JVG2 852 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 PPM1LQ5SGD2 360 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 POTEHQ6S545 545 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 GPR155Q7Z3F1 870 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 FAM200AQ8TCP9 573 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORD53-201ENST00000579969 APOL6Q9BWW8 343 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 CHST12Q9NRB3 414 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 CHST7Q9NS84 486 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53-201ENST00000579969 PKD2L1Q9P0L9 805 aa2.75□□□□□ -1.97
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