RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.37	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SOD2	P04179	222 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX3	P56589	373 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DSC1	Q08554	894 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	MARCH5	Q9NX47	278 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.36	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	C2CD2L	O14523	706 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	LILRB3	O75022	631 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	HIP1R	O75146	1068 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TADA2A	O75478	443 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	UROD	P06132	367 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	EPCAM	P16422	314 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	NPTX2	P47972	431 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	GRIK3	Q13003	919 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CUL4A	Q13619	759 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	HYI	Q5T013	277 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNK18	Q7Z418	384 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CABP7	Q86V35	215 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PLIN2	Q99541	437 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	NCOR1	O75376	2440 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	EFEMP2	O95967	443 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	EDN1	P05305	212 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TH	P07101	528 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	PDC	P20941	246 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	MTHFR	P42898	656 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	GLUD2	P49448	558 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	CLCN4	P51793	760 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DSG1	Q02413	1049 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	TUSC3	Q13454	348 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	BRAP	Q7Z569	592 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DAW1	Q8N136	415 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	EDA	Q92838	391 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIFC3-231	ENST00000567479	AK8	Q96MA6	479 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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