RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 RPS6KC1Q96S38 1066 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 RAB34Q9BZG1 259 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 A0A1B0GUA9 196 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 E9PMD0 336 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 INPPL1O15357 1258 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 MYBP10242 640 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 MUTP22033 750 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 KLRC2P26717 231 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 NAMPTP43490 491 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 GIT2Q14161 759 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PPP2R5AQ15172 486 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 MAPK6Q16659 721 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 FAM187BQ17R55 369 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 KRT79Q5XKE5 535 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 CES5AQ6NT32 575 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 TAS1R1Q7RTX1 841 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 CABP7Q86V35 215 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 RABGGTAQ92696 567 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 B3GALT6Q96L58 329 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 IFT74Q96LB3 600 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 KLHL5Q96PQ7 755 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 FZD8Q9H461 694 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 POMKQ9H5K3 350 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 SNTG2Q9NY99 539 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 CACNG4Q9UBN1 327 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 IRAK3Q9Y616 596 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 LAD1O00515 517 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 ACKR2O00590 384 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 N4BP3O15049 544 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 NR1I2O75469 434 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 RECQL4O94761 1208 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 SOD2P04179 222 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 DSC1Q08554 894 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 GRIK3Q13003 919 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PDIA5Q14554 519 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 USP34Q70CQ2 3546 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 KCNK18Q7Z418 384 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 HASPINQ8TF76 798 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 KIFAP3Q92845 792 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 PLIN2Q99541 437 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 STK39Q9UEW8 545 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 DNM3Q9UQ16 869 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 GDAQ9Y2T3 454 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa10.02□□□□□ -0.8
MFGE8-213ENST00000560553 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 CCDC169A6NNP5 214 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 LILRB3O75022 631 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 HIP1RO75146 1068 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 PRPHP41219 470 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 MTHFRP42898 656 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 GLUD2P49448 558 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 MCM2P49736 904 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 CLCN4P51793 760 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 PEX3P56589 373 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 ZXDAP98168 799 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 ITIH3Q06033 890 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 NT5DC1Q5TFE4 455 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 KIAA1841Q6NSI8 718 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 FUT10Q6P4F1 479 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 ZBTB33Q86T24 672 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 EDAQ92838 391 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 FAM122AQ96E09 287 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 FBXL18Q96ME1 805 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 NECTIN4Q96NY8 510 aa10.02□□□□□ -0.81
MFGE8-213ENST00000560553 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms