RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 VAMP7P51809 220 aa15.56■□□□□ 0.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.55■□□□□ 0.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.55■□□□□ 0.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.55■□□□□ 0.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
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RABGGTA-209ENST00000559551 CLDN10P78369 228 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGGTA-209ENST00000559551 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
RABGGTA-209ENST00000559551 PSMD6Q15008 389 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGGTA-209ENST00000559551 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGGTA-209ENST00000559551 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
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