RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 RNF135Q8IUD6 432 aa21.47■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.47■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 PARP2Q9UGN5 583 aa21.47■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 LIG1P18858 919 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 GRIK3Q13003 919 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 KCNK18Q7Z418 384 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 APOL5Q9BWW9 433 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 KLK14Q9P0G3 267 aa21.46■■□□□ 1.03
CBLN3-202ENST00000555436 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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CBLN3-202ENST00000555436 EFEMP2O95967 443 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 SOD2P04179 222 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 EDN1P05305 212 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 ITIH3Q06033 890 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CUL4AQ13619 759 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 HYIQ5T013 277 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 DAW1Q8N136 415 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.45■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 USP20Q9Y2K6 914 aa21.45■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 HIP1RO75146 1068 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 EPCAMP16422 314 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 NPTX2P47972 431 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CES5AQ6NT32 575 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 BRAPQ7Z569 592 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 DRC1Q96MC2 740 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.44■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 F8W810 466 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 K7ERI5 159 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 URODP06132 367 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 PNMA5Q96PV4 448 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 TIPINQ9BVW5 301 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 SNTG2Q9NY99 539 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.43■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CCDC169A6NNP5 214 aa21.42■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 RECQL4O94761 1208 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 GUCY2CP25092 1073 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 KLRC2P26717 231 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 MAPK7Q13164 816 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 AK8Q96MA6 479 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 BACH2Q9BYV9 841 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CDH22Q9UJ99 828 aa21.42■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 C2CD2LO14523 706 aa21.41■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 BMP15O95972 392 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 GLUD2P49448 558 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CLCN4P51793 760 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 TUSC3Q13454 348 aa21.41■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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CBLN3-202ENST00000555436 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 CHST7Q9NS84 486 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 SLC26A4O43511 780 aa21.4■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 PDCP20941 246 aa21.4■■□□□ 1.02
CBLN3-202ENST00000555436 MTHFRP42898 656 aa21.4■■□□□ 1.02
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